Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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SHROOM2Q13796 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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