Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms