Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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