Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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