Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms