Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMP3P12645 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMP3P12645 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMP3P12645 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms