Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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