Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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