Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms