Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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