Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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