Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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