Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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