Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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