Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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