Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms