Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORAP35398 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORAP35398 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORAP35398 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms