Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms