Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms