Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms