Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRRTQ9BXP5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms