Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms