Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM47Q96LD4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM47Q96LD4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms