Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms