Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms