Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST3Q8N1M1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST3Q8N1M1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST3Q8N1M1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST3Q8N1M1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST3Q8N1M1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST3Q8N1M1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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