Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL24A1Q17RW2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms