Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA2P42262 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms