Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms