Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms