Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4L1Q8NHW4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms