Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms