Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SS18Q15532 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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