Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms