Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM27E3Q08E93 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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