Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN1Q04323 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms