Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx1P48377 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms