Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms