Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POP4O95707 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POP4O95707 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POP4O95707 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms