Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms