Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms