Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM175Q9BSA9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM175Q9BSA9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms