Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms