Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms