Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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