Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GPS1Q13098 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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