Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms