Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTX3P26022 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms