Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms