Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms